Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc27Q3V036 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms