Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms