Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms