Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5aQ3UXZ9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms