Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clpsl2Q3UW21 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms