Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Skap1Q3UUV5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap1Q3UUV5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Skap1Q3UUV5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Skap1Q3UUV5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skap1Q3UUV5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skap1Q3UUV5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skap1Q3UUV5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skap1Q3UUV5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skap1Q3UUV5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skap1Q3UUV5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms