Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thsd4Q3UTY6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Thsd4Q3UTY6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Thsd4Q3UTY6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Thsd4Q3UTY6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thsd4Q3UTY6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thsd4Q3UTY6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thsd4Q3UTY6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thsd4Q3UTY6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thsd4Q3UTY6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thsd4Q3UTY6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thsd4Q3UTY6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thsd4Q3UTY6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thsd4Q3UTY6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Thsd4Q3UTY6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thsd4Q3UTY6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thsd4Q3UTY6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms