Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Obox3Q3UT54 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Obox3Q3UT54 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms