Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms