Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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