Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms