Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms