Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf224Q3UIW8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf224Q3UIW8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf224Q3UIW8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf224Q3UIW8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf224Q3UIW8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf224Q3UIW8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf224Q3UIW8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf224Q3UIW8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf224Q3UIW8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf224Q3UIW8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf224Q3UIW8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms