Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms