Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnrc6cQ3UHC0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms