Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms