Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Fam117bQ3U3E2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Fam117bQ3U3E2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam117bQ3U3E2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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