Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec24aQ3U2P1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec24aQ3U2P1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms