Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KhsrpQ3U0V1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KhsrpQ3U0V1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KhsrpQ3U0V1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KhsrpQ3U0V1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KhsrpQ3U0V1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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