Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms