Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TTJ4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms