Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms