Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms