Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KncnQ307W7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KncnQ307W7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KncnQ307W7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KncnQ307W7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KncnQ307W7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KncnQ307W7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms