Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pi4k2aQ2TBE6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pi4k2aQ2TBE6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pi4k2aQ2TBE6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pi4k2aQ2TBE6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pi4k2aQ2TBE6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pi4k2aQ2TBE6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pi4k2aQ2TBE6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pi4k2aQ2TBE6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms