Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms