Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG1

Rhox4c, MCG125587, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4cQ2MDG1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox4cQ2MDG1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms