Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cpne9Q1RLL3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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