Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Arhgap9Q1HDU4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap9Q1HDU4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms