Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sap25Q1EHW4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms