Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Fam171bQ14CH0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Fam171bQ14CH0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Fam171bQ14CH0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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