Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gli2Q0VGT2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms