Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmntd2Q0VET5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmntd2Q0VET5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmntd2Q0VET5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms