Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms