Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rundc1Q0VDN7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms