Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms