Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spata18Q0P557 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms