Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurl1bQ0MW30 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms