Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn2bQ0KL01 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms