Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms