Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nfe2Q07279 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nfe2Q07279 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms