Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms