Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms