Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpd1Q04519 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms