Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RelaQ04207 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RelaQ04207 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RelaQ04207 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RelaQ04207 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelaQ04207 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelaQ04207 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelaQ04207 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RelaQ04207 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RelaQ04207 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RelaQ04207 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RelaQ04207 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RelaQ04207 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RelaQ04207 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RelaQ04207 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RelaQ04207 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RelaQ04207 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RelaQ04207 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms