Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms