Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms