Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms