Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gjb4Q02738 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms