Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms